Me vas a disculpar todo el calentón de cabeza que te di, el problema es que me despisté, uso un hdd para xplane y un ssd para el sistema, tenia la carpeta con los archivos que importaba al wed en el ssd y el custom scenery en el hdd, una vez todo agrupado en el hdd no hay problema, me he dado cuenta revisando todas las cosas que me pediste en tu respuesta, gracias porque así he podido encontrar la solución.
Bueno, esas cosas pasan, no te preocupes.
Te recuerdo:
http://www.x-plane.es/modules/smf/index.php?topic=3243.0 (hay que presentarse primero)