Solucionado. Me he puesto a mirar posibles errores relacionados con el x-ivap en el log.txt y encontré algo que ayer ignoré:
X-IvAp: Teamspeak: trying to load sdk from C:\X-Plane 9.00 Beta-1\Resources\plugins\X-IvAp Resources\TSRemote.dll
Y luego debajo una linea que ponía que "sdk not found". Así que nada, a tirar de google para buscar ese archivo. Lo encontré, lo puse en ese directorio, busqué una frecuencia activa en el ojo y ha conectado sin problemas. Ahora será cuestión de probar el mismo invento con la 1.9
EDIT. Funciona