Ahi has dado en el clavo, vamos por partes, en Custom Scenery puedes tener:
a) AEROPUERTOS - pistas, calles rodaje, parkings, lineas, etc. solo contiene un fichero en la carpeta Eart nav data con nombre apt.dat
b) escenarios fotograficos como los del FTP - google con 3 carpetas
c) EDIFICIOS de todo tipo barcos, etc. como el Catalunya - con 3 o mas carpetas
d) Aeropuertos con las pintadas señaladores en el suelo que sería como el "C" ejemplo APT-Barcelona
solo se deben objetos en éstos dos últimos o crear uno nuevo, el OE te da la opcion de crear uno de nuevo. el primer icono de la izquierda arriba, si pones el puntero te dice que es cada icono, por cierto, has leido el manual??