La diferencia de rendimiento es lógica; Windows usa los recursos del equipo para sí mismo, y Linux te los deja libres para los programas.
Yo tengo el Ubuntu a pelo, sin configurar. Lo terminé de instalar ayer mismo y está tal cual, y encima me baje una versión que no es la buena para mi procesador, no me baje la que hay para AMD64, pero estoy mu perro pa cambiarla ahora.
Si así tira como una cabra, os podéis imaginar cómo debe ser si compilas el propio núcleo para tu equipo en especial y que se ajuste como un guante a tu hardware.
Para instalar X-Plane solo tienes que instalar una librería antigua que te pide; libopenal.so.0 La instalas y a correr X-Plane.
La comparación de ayer la hice con la Cessna 172, en Ibiza con meteo real y escenario completo de G2xpl. Sobre el mar, en Linux se iba a más de 160 FPS