Y yo me pregunto... para qué los quieres quitar? Son los objetos por defecto de X-Plane que llenan todo el globo terráqueo.
Ahora, si prefieres no tenerlos en zonas con fotorreales tendrás que tirar de WED, como bien dice Jordi, y crear un escenario vacío, con una zona de exclusión de objetos 3D y fachadas que abarque el área que tú quieras. Luego exportas y le das prioridad al mismo.
Y no, no vale decir que no sé utilizar el WED o algo similar. Hay un hermoso manual en español en la zona de descargas y si uno quiere conseguir algo concreto como eso, debe esforzarse un poco.