Cuando asignas transparencia tanto en pistas como taxi además de eliminar la textura también pierden las propiedades de superfície.
Ahora no lo recuerdo seguro pero creo que mediante un draped polygon sin textura puedes crear una zona invisible con propiedades de superficie.
Crea un archivo .pol que contenga eso y mételo con el WED encima de la pista y taxis a ver si funciona:
A
850
DRAPED_POLYGON
TEXTURE
SCALE 1 1
LAYER_GROUP Airports +1
SURFACE asphalt