Da la impresión de que tuvieras otro joystick instalado y configurado para las mismas palancas (o el mismo Saitek, otras palancas). Revisa la configuración, en opciones de joystick, por is fuera eso y vuelve a recalibrar.
Si aún no funciona, sal del XP y cárgate los archivos de preferencias (.prf); en concreto, los de calibración (no recuerdo su nombre). Bueno, mejor que eliminarlos, muévelos a un sitio seguro. Luego arrancas de nuevo el XP11 y vuelves a configurar y calibrar.
Si aún falla, recuerda que el XP11 es actualmente una beta y puede hacer éstas y otras cosas... En este caso, pon un \"bug\" a Laminar acerca del error:
http://dev.x-plane.com/support/bugreport.html